Munculnya gerakan Muslim kulit hitam di daerah perkotaan sekitar Gauteng khususnya. Dewan Syura Muslim Gauteng (GMSC) ini merupakan hasil dari banyak ketidakpuasan terhadap organisasi-organisasi di atas yang sebagian besar terdiri dari orang India dan campuran dan dipandang sebagai penjajah pemikiran kulit hitam ke dalam versi Islam Indopak.
GMSC sekarang memiliki sumber daya di semua daerah perkotaan Gauteng dengan syura regional yang dipimpin oleh Amir. Amir Mohammed Gadimang adalah pemimpin kelompok ini. Dengan Amir regional terkemuka lainnya Zaid Langa (Soweto) dan Abdul Qadir Mandla Nkosi (Tshwane) yang merupakan Amir regional terbesar.
Selain partai politik, sejumlah organisasi Islam beroperasi di Afrika Selatan, mengurus berbagai aspek kehidupan Muslim.
Organisasi-organisasi besar meliputi Dewan Kehakiman Muslim , yang kegiatannya mencakup penyediaan sertifikasi Halal untuk makanan. Dewan Ulama Cape Town (CTUB), sebuah suara progresif yang kegiatannya berkaitan dengan dialog Pemerintah dan fatwa agama.
Dewan Haji dan Umrah Afrika Selatan (SAHUC) mengurus kebutuhan para peziarah Afrika Selatan dan bertanggung jawab atas penerbitan izin Haji. Terdapat banyak organisasi lokal lainnya yang ada untuk mengurus kepentingan komunitas Muslim.
