Sebagai balasan, Portugis melancarkan kampanye besar dengan 1000 orang pada tahun 1568 dan para pedagang Swahili di Zambezi dibantai dengan kekejaman yang mengerikan.
Setelah itu, kehadiran Muslim di Zimbabwe menurun. Meskipun pada tahun 1630-an Mutapa memberikan wilayah kecil kepada seorang Syarif Muslim.
Satu dekade kemudian dalam perang saudara Torwa pada tahun 1640-an banyak Muslim terbunuh. Setelah itu, setiap Muslim yang tersisa di Zimbabwe secara bertahap berasimilasi ke dalam budaya Shona.
Satu-satunya sisa dari kehadiran Islam sebelumnya di Zimbabwe adalah fragmen pengaruh Islam di antara masyarakat Lemba.
Komunitas Muslim terutama terdiri dari imigran Asia Selatan (India dan Pakistan), sejumlah kecil tetapi terus bertambah penduduk asli Zimbabwe, dan migran dari negara-negara Afrika lainnya seperti suku Yao dari negara tetangga Malawi.
