Pada tahun 1992, ia diangkat menjadi direktur penelitian di Institut Astrofisika Paris. Ia menjabat sebagai ilmuwan asosiasi di Observatorium Luar Angkasa Herschel dan Planck (pesawat ruang angkasa) Badan Antariksa Eropa, yang diluncurkan pada 14 Mei 2009.
Guiderdoni menyelesaikan kewajiban dinas nasionalnya sebagai guru fisika di sebuah sekolah menengah Perancis di Casablanca. Dia masuk Islam pada tahun 1987 setelah diperkenalkan di Maroko.
Dari tahun 1993 hingga 1999, ia memimpin sebuah acara televisi berjudul “Mengenal Islam”, yang disiarkan di saluran televisi pemerintah Prancis. Guiderdoni telah menulis lebih dari 100 makalah ilmiah dan banyak menulis tentang teologi Islam dan mistisisme.
Ia digambarkan sebagai bagian dari “penulis generasi baru” yang terlibat dalam diskusi mengenai Islam dan sains, termasuk tokoh-tokoh seperti Mehdi Golshani, Basil Altaie, dan Nidhal Guessoum.
Ia telah memberikan banyak ceramah tentang spiritualitas dan hubungan antara sains dan agama di bawah naungan Institut Studi Lanjutan Islam (Institut des Hautes Etudes Islamiques). Ia secara aktif mempromosikan dialog antaragama, khususnya di antara agama-agama Ibrahim.(*)
